Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Stip1Q60864 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms