Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nr2f1Q60632 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms