Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc1Q60596 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Xrcc1Q60596 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrcc1Q60596 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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