Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gprasp1Q5U4C1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms