Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc125Q5U465 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms