Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp78Q5U406 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms