Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam71bQ5STT6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms