Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS90

Gm11992, Uncharacterized protein C7orf57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11992Q5SS90 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm11992Q5SS90 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm11992Q5SS90 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms