Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
WhammQ571B6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WhammQ571B6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms