Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf608Q56A10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf608Q56A10 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms