Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrig2Q52KR2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrig2Q52KR2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms