Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otol1Q4ZJM7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otol1Q4ZJM7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms