Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2al1nQ497L1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms