Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc110Q3V125 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms