Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cnga4Q3UW12 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cnga4Q3UW12 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms