Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr1d1Q3UV55 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms