Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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