Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upf3bQ3ULL6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upf3bQ3ULL6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms