Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trip13Q3UA06 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trip13Q3UA06 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms