Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q3U6N9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms