Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q3U595 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q3U595 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q3U595 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q3U595 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms