Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hvcn1Q3U2S8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms