Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4dQ3U2K5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kdm4dQ3U2K5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms