Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt2Q3TTY5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt2Q3TTY5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms