Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc102aQ3TMW1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms