Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Treml4Q3LRV9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Treml4Q3LRV9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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