Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd11Q1RNF8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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