Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim71Q1PSW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim71Q1PSW8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms