Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fam171bQ14CH0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Fam171bQ14CH0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Fam171bQ14CH0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam171bQ14CH0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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