Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Rpusd3Q14AI6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpusd3Q14AI6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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