Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Spatc1Q148B6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Spatc1Q148B6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Spatc1Q148B6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Spatc1Q148B6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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