Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc162pQ0VG85 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc162pQ0VG85 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms