Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn2bQ0KL01 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn2bQ0KL01 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms