Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssrp1Q08943 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms