Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnma1Q08460 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms