Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Col17a1Q07563 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col17a1Q07563 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms