Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cntn3Q07409 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cntn3Q07409 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms