Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atf4Q06507 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms