Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal1Q05A62 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms