Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprgQ05909 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprgQ05909 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms