Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox12Q04890 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox12Q04890 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms