Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sox8Q04886 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms