Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msx2Q03358 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms