Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nhlh1Q02576 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms