Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zfp39Q02525 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zfp39Q02525 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms