Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pde1bQ01065 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pde1bQ01065 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms