Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb2Q00977 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms