Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga4Q00651 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Itga4Q00651 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms