Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx1P81068 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms