Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Otx1P80205 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms